Geo-mapping-Methode zeigt, in welchen potentielle neue therapeutische Angriffspunkte bei lupus

Ein team von Forschern vom Krankenhaus der Kinder von Philadelphia (CHOP), verwendet eine neue Methode zur Lokalisierung von potenziellen Krankheit-verursachen Veränderungen im Genom zu identifizieren, die zwei neue potentielle therapeutische targets für lupus, während auch ebnen den Weg für mehr präzise Identifizierung der krankheitsverursachenden Variationen in anderen Autoimmun-Erkrankungen. Die Ergebnisse wurden online veröffentlicht in Nature Communications.

Genome-wide association studies (GWAS) Hebel-Variationen über das Genom, das komplette set von den Genen eines Menschen und der damit verbundenen DNA, um zu erfahren Sie mehr über die erblichen Krankheiten und Merkmale. Diese Studien ermitteln in der Regel Cluster von Hunderten von single-Nukleotid-polymorophisms, oder Varianten, die Ursache einer bestimmten Krankheit sein, aber die Studien selbst sind nicht in der Lage zu identifizieren, welche verantwortlich sind. Dies ist, weil die überwiegende Mehrzahl der Varianten nicht in den Genen selbst, sondern in den dazwischen liegenden DNA-und GWAS nicht unbedingt lösen, welche Gene betroffen sind, die durch Krankheit-assoziierten Polymorphismen.

Der systemische Lupus Erythematodes ist eine Autoimmunerkrankung ohne bekannte Heilung, das betrifft sowohl Kinder und Erwachsene, die mit einer größeren Prävalenz unter den ethnischen Minderheiten. Während mehrere Studien über die lupus haben, konzentriert sich auf die naiven T-Helferzellen und anderen Zellen im Blut, diese Studie wurde konzipiert, um den Fokus auf follikuläre Helfer T-Zellen, spielen eine zentrale Rolle in der Immunantwort in Bezug auf lupus. Statt einer typischen GWAS-Ansatz, den die Forscher mit drei-dimensionalen Karten, match-Varianten, die mit den Genen haben Sie sich wahrscheinlich regulieren. Ihren Ansatz, die Varianten als „Wegweiser“ zu identifizieren potentielle gene Enhancer in normalem Gewebe.

„Vor dieser Studie, keine 3-D structural genomic maps erzeugt worden waren, für diese lupus-relevanten Zelltyp vor,“ sagte Andrew D. Wells, Ph. D., Co-Direktor des Zentrums für die Räumliche und Funktionelle Genomik am HACKEN, und co-senior-Autor der Studie zusammen mit Struan F. A. Grant, Ph. D. „Mit unserem Ansatz, wir glauben, wir waren in der Lage, Gene zu identifizieren, und Wege, hatte zuvor keine bekannte Rolle in lupus.“

Mit dieser Methode, die Studiengruppe identifiziert 393-Varianten in der Nähe von Genen, die in 3-D, und daher potenziell involviert in die regulation. Etwa 90% dieser Varianten wurden als weit entfernt, um Ihre gene in eine dimension, waren aber tatsächlich in der Nähe in der richtigen dreidimensionale Karte erstellt durch das team. Die Forscher waren in der Lage zu lokalisieren, zwei Kinasen, HIPK1 und MINK1, hatte keine bisher bekannte Rolle im lupus. Wenn diese Enzyme gezielt in follikulären Helfer T-Zellen, Sie hemmen die Produktion von interleukin-21, ein Zytokin, involviert in die Regulierung der Antikörper-Produktion.

„Wir glauben, dass HIPK1 und MINK1 dienen als wertvolle therapeutische Ziele für lupus, eine Krankheit, die dringend neue Behandlungsmöglichkeiten,“ Wells sagte. „Auch wir wollen die Methoden, die wir in dieser Studie verwendet und auf andere Autoimmun-Krankheiten und helfen, festzulegen, mehr kausale Varianten, die möglicherweise sonst blieb verdeckt durch GWAS allein.“